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苜蓿、三叶草根瘤菌生物多样性和系统发育地位的研究

专 业: 微生物学
关键词: 根瘤菌 多样性 表型 遗传型 系统发育
分类号: Q939.114  S542.401
形 态: 共 73 页 约 47,815 个字 约 2.287 M内容
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内容摘要


该研究以分离自四川及重庆的三叶草和苜蓿根瘤菌为研究对象,采用数值分类、BOXAIR-PCR、ERIC-PCR、16S rDNA-RFLP、16S rDNA测序技术,从遗传型和表型两方面,系统地对55株未知根瘤菌进行了多样性研究,并初步确定了部分菌株的系统发育及分类地位.生理、生化性状分析表明,分离自两种宿主的根瘤菌具有某些突出的抗性特征,如耐高温、耐低温、耐盐、耐酸碱及耐某些高浓度的抗生素等.有33株菌对7种抗生素的抗性浓度达300μg/m1,8株菌耐5﹪的NaC1,有35株菌在4℃的低温下能够生长,2株菌株能够在60℃情况下生长,有40﹪的菌株可以在pH11.0 YMA培养基上生长,在PH4.0的条件下只有1株可以生长.rep-PCR指纹图谱分析包括BOX-PCR,ERIC-PCR及综合树状图.在87﹪和89﹪的相似性水平上,三者分别将全部菌株聚为29,33,37个群,rep-PCR指纹分析的分群结果更分散,除了单独聚群的菌株外,属、种聚群混乱,分群结果与宿主和地域来源没有明显的相关性.数值分类和16S rDNA PCR-RFLP聚在同一群内的菌株大多分布于几个甚至十几个不同的rep-PCR群内,揭示了供试菌株具有极大的遗传多样性,同时也说明,rep-PCR指纹图谱分析适合于根瘤菌种内遗传多样性研究.综合树状图揭示了菌株之间的更大的遗传差异及菌株的特异性.所有的供试菌株的16S rDNA PCR-RFLP遗传类型图谱有27种.在75﹪的相似水平上,除了IAM13129,B33,711,所有供试菌株全部聚群,分为Rhizobium和Sinorhizobum系统发育分支和未知系统发育分支.在91﹪的相似性水平上,59株供试菌株聚到17个群中.多数分离自雅安和全部分离自西昌的菌株归Sinorhizobium系统发育分支,多数苜蓿根瘤菌归于Rhizobium系统发育分支,还有12株三叶草根瘤菌和5株苜蓿根瘤菌尚待确定其系统发育地位,他们均具有各自独特的遗传类型图谱.所有供试未知菌株的遗传类型图谱没有与参比菌株IAM13129相同的.三叶草根瘤菌遗传特性比苜蓿根瘤菌分化较大,特异性较强.三种方法聚群结果中,都有某些菌株未与参比菌株聚群,可能为新的分类单元.三种结果均不同程度表现出即使与相同地域的同一种宿主植物共生的根瘤菌也具有较大表型及遗传多样性.在上述结果一致的基础上,对TH62和WZ421两个菌株进行了16S rDNA全序列测定.菌株TH62与Rhizorbium leguminosarum模式菌株的序列形似性达到99.6﹪,菌株WZ421与Sinorhizobium meliloti模式菌株的序列相似性达到99.2﹪,说明他们所代表的群7和群8在发育关系上分别属于Rhizobium和Sinorhizobium……

全文目录


中文摘要
Abatract
一文章综述及研究目的
1.1前言
1.2研究进展
1.3研究的目的和意义
二材料与方法
2.1菌株的分离纯化及保藏
2.2比较结瘤实验
2.3供试菌株的选择
2.4表型多样性分析
2.5遗传多样性分析
2.6 16S rDNA全序列测定
三结果分析
3.1供试菌株的结瘤实验及有效性分析
3.2表型多样性分析
3.3 rep-PCR指纹分析
3.4 16S rDNA酶切图谱分析
3.5 16S rDNA全序列分析
四讨论及结论
4.1讨论
4.2结论
参考文献
附录

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中图分类: > Q939.114 > 生物科学 > 微生物学 > 微生物分类学(系统微生物学)
其他分类: > S542.401 > 农业科学 > 农作物 > 饲料作物、牧草 > 一年生豆科牧草

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