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云南赛葵上双生病毒的分子鉴定

专 业: 生物化学与分子生物学
关键词: 赛葵 begomovirus DNA-A DNAβ 复合侵染
分类号: Q4
形 态: 共 64 页 约 41,920 个字 约 2.005 M内容
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内容摘要


双生病毒在云南烟草、番茄以及赛葵、稀硷等多种作物和杂草上广泛发生,并已造成严重危害。

杂草是双生病毒重要的中间寄主和初侵染源,为此我们对云南赛葵上的双生病毒开展了研究。

Y278分离自云南保山的赛葵,全序列测定表明,它与赛葵黄脉病毒MYVV的同源性最高,仅为87.0,因此它是双生病毒新种,命名为赛葵保山黄脉病毒Malvastrum yellow vein Baoshan virus,MYVBSV。

序列比较发现MYVBSV可能是由MYVV和类似于黄花捻曲叶病毒SiLCV的病毒重组产生的。

从云南赛葵样品Y277、Y278和Y281中分离到中国番茄黄曲叶病毒TYLCCNV的DNA-A序列及其伴随的DNAβ序列。

对Y278 DNA-A分子和Y277、Y278、Y281的DNAβ分子进行了全序列测定。

Y278 DNA-A序列和TYLCCNV-Y264同源性达100;三个DNAβ序列也和TYLCCNV伴随的DNAβ同源性最高,达97.0~99.7。

因此,赛葵是TYLCCNV的寄主。

来自云南保山的赛葵样品Y277,全序列测定表明,它与云南赛葵黄脉病毒MYVYNV的同源性最..……

全文目录


目录
摘要
第一章 文献综述
1 概述
1.1 双生病毒的发生与危害
1.2 双生病毒的分类及其基因组结构特征
2 双生病毒伴随的小分子DNA
2.1 DNAβ分子及其特征
2.2 DNA1分子及其特征
2.3 双生病毒与小分子DNA形成病害复合体
3 双生病毒的重组和变异
4 赛葵上双生病毒研究进展
4.1 杂草上双生病毒的研究意义
4.2 赛葵上双生病毒研究现状
第二章 材料与方法
1 材料
1.1 病毒
1.2 植物材料
1.3 菌株和质粒
1.4 试剂与仪器
1.5 常用缓冲液的配制
2 方法
2.1 PCR技术
2.2 PCR产物纯化
2.3 DNA克隆技术
2.4 重组质粒的提取与鉴定
2.5 植物总DNA提取CTAB法
第三章 赛葵上双生病毒的分子鉴定
第一节 赛葵保山黄脉病毒的分子鉴定
1 材料与方法
1.1 病毒
1.2 PCR扩增、克隆及序列测定
1.3 序列分析
2 结果与分析
2.1 PA、PB序列分析
2.2 病毒基因组DNA-A结构
2.3 Y278 DNA-A与其它双生病毒的比较及分子进化分析
2.4 Y278是重组形成的病毒
3 讨论
第二节 侵染赛葵的中国番茄黄曲叶病毒的分子鉴定
1 材料与方法
1.1 病毒
1.2 PCR扩增、克隆及序列测定
1.3 序列分析
2 结果与讨论
第三节 云南赛葵黄脉病毒的致病性测定
1 材料与方法
1.1 病毒
1.2 PCR扩增、克隆及序列测定
1.3 序列分析
1.4 MYVYNV-Y277 DNA-A侵染性克隆的构建
1.5 侵染性克隆的转化
1.6 农杆菌接种
1.7 病毒DNA的PCR鉴定
2 结果与分析
2.1 MYVYNV-Y277 DNA-A和Y160 DNAβ的致病性测定
2.2 MYVYNV-Y277寄主范围的测定
3 讨论
第四节 复合侵染的检测
1 材料与方法
1.1 病毒
1.2 PCR扩增、克隆和测序
1.3 序列分析
2 结果与分析
2.1 DNA-A复合侵染检测
2.2 卫星分子DNAβ及DNA1的检测
3 讨论
参考文献
附录A:常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器
附录B:常用缓冲液及培养基配方

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中图分类: > Q4 > 生物科学 > 生理学

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